Şükrü Ayalan, 1 Temmuz 1963'te Tokat'ta doğdu. Babasının adı Ahmet Hamdi, annesinin adı Cemile'dir.
Tıp Doktoru; Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesini bitirdi. Psikiyatri İhtisasını Viyana Üniversitesi Tıp Fakültesinde tamamladı.Viyana Üniversitesi Tıp Fakültesi Psikiyatri Kliniğinde asistan doktor olarak çalışmaya başladı. Avrupa'da yaşayan Türk işçi ailelerinin ve çocuklarının uyum ve davranışları konularında çalışmalar yaptı. Bu çalışmalarla ilgili makalesi ulusal ve uluslararası dergilerde yayınlandı. İzmir, Turhal ve Tokat Devlet Hastanelerinde psikiyatri uzmanlığı görevinde bulundu. Serbest hekim olarak çalışma hayatına devam etti.
22 ve 23. Dönemde Tokat Milletvekili seçildi. 22, 23 ve 24. Dönemde TBMM Avrupa Güvenlik ve İşbirliği Teşkilatı Parlamenter Asamblesi Türk Grubu Üyesi oldu.
İyi düzeyde Almanca, orta düzeyde İngilizce bilen Ayalan, evli ve 4 çocuk babasıdır.